2010年1月，根据教育部科技发展中心教技发中心[2010]9号函件：“关于公布2009年度‘中国科技论文在线’优秀期刊评选结果的通知”，教育部科技发展中心对截至2009年11月30日已收录在“中国科技论文在线”科技期刊栏目的教育部主管的期刊就期刊的学术质量、入网情况、下载率、开放存取、编委国际化程度等多项指标进行了统计分析和评审，本次评审中“影响因子和他引率”、“网站收录论文数和下载量”、“期刊入网的完整性”等量化指标占较大权重。经过严格的评审，《重庆理工大学学报》（自然科学）喜获一等奖，全国共评出一等奖期刊仅30名。该奖极大地提高了我校及《重庆理工大学学报》的知名度和影响力。